Protein–RNA interactions for Protein: Q61165

Slc9a1, Sodium/hydrogen exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a1Q61165 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc9a1Q61165 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc9a1Q61165 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc9a1Q61165 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc9a1Q61165 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc9a1Q61165 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc9a1Q61165 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc9a1Q61165 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc9a1Q61165 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc9a1Q61165 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc9a1Q61165 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc9a1Q61165 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc9a1Q61165 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc9a1Q61165 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc9a1Q61165 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc9a1Q61165 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc9a1Q61165 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc9a1Q61165 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc9a1Q61165 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc9a1Q61165 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc9a1Q61165 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc9a1Q61165 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc9a1Q61165 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc9a1Q61165 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc9a1Q61165 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc9a1Q61165 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc9a1Q61165 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc9a1Q61165 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc9a1Q61165 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc9a1Q61165 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc9a1Q61165 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc9a1Q61165 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc9a1Q61165 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc9a1Q61165 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms