Protein–RNA interactions for Protein: Q61146

Ocln, Occludin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OclnQ61146 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OclnQ61146 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OclnQ61146 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OclnQ61146 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OclnQ61146 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
OclnQ61146 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
OclnQ61146 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
OclnQ61146 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
OclnQ61146 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms