Protein–RNA interactions for Protein: Q61144

Psen2, Presenilin-2, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen2Q61144 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psen2Q61144 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psen2Q61144 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psen2Q61144 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psen2Q61144 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psen2Q61144 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psen2Q61144 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psen2Q61144 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Psen2Q61144 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psen2Q61144 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psen2Q61144 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psen2Q61144 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psen2Q61144 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psen2Q61144 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Psen2Q61144 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psen2Q61144 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psen2Q61144 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psen2Q61144 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psen2Q61144 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psen2Q61144 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psen2Q61144 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psen2Q61144 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psen2Q61144 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psen2Q61144 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psen2Q61144 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psen2Q61144 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psen2Q61144 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psen2Q61144 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psen2Q61144 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psen2Q61144 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psen2Q61144 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Psen2Q61144 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psen2Q61144 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psen2Q61144 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psen2Q61144 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psen2Q61144 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psen2Q61144 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psen2Q61144 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Psen2Q61144 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Psen2Q61144 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Psen2Q61144 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psen2Q61144 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psen2Q61144 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psen2Q61144 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psen2Q61144 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psen2Q61144 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psen2Q61144 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psen2Q61144 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psen2Q61144 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psen2Q61144 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psen2Q61144 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psen2Q61144 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psen2Q61144 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psen2Q61144 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psen2Q61144 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psen2Q61144 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psen2Q61144 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psen2Q61144 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psen2Q61144 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psen2Q61144 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psen2Q61144 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psen2Q61144 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Psen2Q61144 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Psen2Q61144 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Psen2Q61144 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psen2Q61144 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psen2Q61144 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psen2Q61144 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psen2Q61144 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psen2Q61144 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psen2Q61144 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psen2Q61144 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psen2Q61144 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Psen2Q61144 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psen2Q61144 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psen2Q61144 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psen2Q61144 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psen2Q61144 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psen2Q61144 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psen2Q61144 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psen2Q61144 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psen2Q61144 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psen2Q61144 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psen2Q61144 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psen2Q61144 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Psen2Q61144 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psen2Q61144 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Psen2Q61144 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psen2Q61144 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psen2Q61144 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psen2Q61144 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psen2Q61144 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psen2Q61144 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psen2Q61144 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psen2Q61144 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psen2Q61144 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psen2Q61144 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psen2Q61144 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Psen2Q61144 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psen2Q61144 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms