Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cln3Q61124 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cln3Q61124 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cln3Q61124 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cln3Q61124 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cln3Q61124 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cln3Q61124 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cln3Q61124 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cln3Q61124 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cln3Q61124 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cln3Q61124 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cln3Q61124 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cln3Q61124 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cln3Q61124 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cln3Q61124 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Cln3Q61124 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Cln3Q61124 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cln3Q61124 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cln3Q61124 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cln3Q61124 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cln3Q61124 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cln3Q61124 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cln3Q61124 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cln3Q61124 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cln3Q61124 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cln3Q61124 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cln3Q61124 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cln3Q61124 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cln3Q61124 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cln3Q61124 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cln3Q61124 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cln3Q61124 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cln3Q61124 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cln3Q61124 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cln3Q61124 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cln3Q61124 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cln3Q61124 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cln3Q61124 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cln3Q61124 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cln3Q61124 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cln3Q61124 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cln3Q61124 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cln3Q61124 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cln3Q61124 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cln3Q61124 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cln3Q61124 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cln3Q61124 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cln3Q61124 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cln3Q61124 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cln3Q61124 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cln3Q61124 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cln3Q61124 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cln3Q61124 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cln3Q61124 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cln3Q61124 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cln3Q61124 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cln3Q61124 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cln3Q61124 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cln3Q61124 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cln3Q61124 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cln3Q61124 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cln3Q61124 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cln3Q61124 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cln3Q61124 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cln3Q61124 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cln3Q61124 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cln3Q61124 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cln3Q61124 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cln3Q61124 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cln3Q61124 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cln3Q61124 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cln3Q61124 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cln3Q61124 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Cln3Q61124 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Cln3Q61124 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Cln3Q61124 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cln3Q61124 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cln3Q61124 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cln3Q61124 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cln3Q61124 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cln3Q61124 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cln3Q61124 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cln3Q61124 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cln3Q61124 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cln3Q61124 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cln3Q61124 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cln3Q61124 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cln3Q61124 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cln3Q61124 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cln3Q61124 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cln3Q61124 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cln3Q61124 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cln3Q61124 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cln3Q61124 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cln3Q61124 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cln3Q61124 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cln3Q61124 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cln3Q61124 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cln3Q61124 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cln3Q61124 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms