Protein–RNA interactions for Protein: Q61043

Nin, Ninein, mousemouse

Predictions only

Length 2,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinQ61043 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NinQ61043 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NinQ61043 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NinQ61043 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NinQ61043 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NinQ61043 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NinQ61043 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NinQ61043 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NinQ61043 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NinQ61043 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NinQ61043 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NinQ61043 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NinQ61043 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NinQ61043 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NinQ61043 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NinQ61043 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NinQ61043 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NinQ61043 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NinQ61043 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NinQ61043 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NinQ61043 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NinQ61043 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NinQ61043 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NinQ61043 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NinQ61043 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NinQ61043 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NinQ61043 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NinQ61043 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NinQ61043 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NinQ61043 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NinQ61043 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NinQ61043 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NinQ61043 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NinQ61043 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NinQ61043 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NinQ61043 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NinQ61043 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NinQ61043 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NinQ61043 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NinQ61043 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NinQ61043 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NinQ61043 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NinQ61043 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NinQ61043 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NinQ61043 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NinQ61043 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NinQ61043 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NinQ61043 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NinQ61043 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NinQ61043 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NinQ61043 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NinQ61043 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NinQ61043 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NinQ61043 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NinQ61043 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NinQ61043 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NinQ61043 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NinQ61043 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NinQ61043 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NinQ61043 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NinQ61043 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NinQ61043 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NinQ61043 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NinQ61043 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NinQ61043 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NinQ61043 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NinQ61043 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NinQ61043 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NinQ61043 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NinQ61043 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NinQ61043 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NinQ61043 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NinQ61043 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NinQ61043 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NinQ61043 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NinQ61043 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NinQ61043 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NinQ61043 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NinQ61043 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NinQ61043 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NinQ61043 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NinQ61043 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NinQ61043 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NinQ61043 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NinQ61043 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NinQ61043 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NinQ61043 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NinQ61043 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NinQ61043 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NinQ61043 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NinQ61043 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NinQ61043 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NinQ61043 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NinQ61043 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NinQ61043 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NinQ61043 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NinQ61043 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NinQ61043 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NinQ61043 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NinQ61043 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms