Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppp1r1bQ60829 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppp1r1bQ60829 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppp1r1bQ60829 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppp1r1bQ60829 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ppp1r1bQ60829 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp1r1bQ60829 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp1r1bQ60829 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp1r1bQ60829 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp1r1bQ60829 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp1r1bQ60829 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp1r1bQ60829 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ppp1r1bQ60829 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp1r1bQ60829 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp1r1bQ60829 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp1r1bQ60829 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp1r1bQ60829 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp1r1bQ60829 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp1r1bQ60829 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp1r1bQ60829 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ppp1r1bQ60829 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp1r1bQ60829 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp1r1bQ60829 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp1r1bQ60829 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp1r1bQ60829 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp1r1bQ60829 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp1r1bQ60829 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp1r1bQ60829 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp1r1bQ60829 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ppp1r1bQ60829 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ppp1r1bQ60829 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp1r1bQ60829 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp1r1bQ60829 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp1r1bQ60829 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp1r1bQ60829 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp1r1bQ60829 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp1r1bQ60829 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp1r1bQ60829 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp1r1bQ60829 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp1r1bQ60829 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ppp1r1bQ60829 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppp1r1bQ60829 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppp1r1bQ60829 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ppp1r1bQ60829 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppp1r1bQ60829 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppp1r1bQ60829 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ppp1r1bQ60829 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppp1r1bQ60829 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppp1r1bQ60829 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppp1r1bQ60829 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppp1r1bQ60829 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppp1r1bQ60829 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppp1r1bQ60829 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppp1r1bQ60829 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppp1r1bQ60829 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppp1r1bQ60829 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppp1r1bQ60829 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ppp1r1bQ60829 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppp1r1bQ60829 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppp1r1bQ60829 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppp1r1bQ60829 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppp1r1bQ60829 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppp1r1bQ60829 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppp1r1bQ60829 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppp1r1bQ60829 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppp1r1bQ60829 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ppp1r1bQ60829 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp1r1bQ60829 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp1r1bQ60829 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp1r1bQ60829 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp1r1bQ60829 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp1r1bQ60829 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp1r1bQ60829 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp1r1bQ60829 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp1r1bQ60829 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ppp1r1bQ60829 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp1r1bQ60829 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp1r1bQ60829 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp1r1bQ60829 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp1r1bQ60829 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp1r1bQ60829 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ppp1r1bQ60829 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp1r1bQ60829 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp1r1bQ60829 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp1r1bQ60829 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp1r1bQ60829 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ppp1r1bQ60829 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp1r1bQ60829 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp1r1bQ60829 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp1r1bQ60829 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp1r1bQ60829 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp1r1bQ60829 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp1r1bQ60829 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp1r1bQ60829 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp1r1bQ60829 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp1r1bQ60829 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp1r1bQ60829 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ppp1r1bQ60829 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp1r1bQ60829 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ppp1r1bQ60829 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms