Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nr2f1Q60632 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nr2f1Q60632 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nr2f1Q60632 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nr2f1Q60632 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nr2f1Q60632 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nr2f1Q60632 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nr2f1Q60632 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nr2f1Q60632 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nr2f1Q60632 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nr2f1Q60632 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nr2f1Q60632 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nr2f1Q60632 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr2f1Q60632 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr2f1Q60632 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr2f1Q60632 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr2f1Q60632 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr2f1Q60632 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr2f1Q60632 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr2f1Q60632 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr2f1Q60632 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr2f1Q60632 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr2f1Q60632 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr2f1Q60632 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr2f1Q60632 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr2f1Q60632 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr2f1Q60632 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nr2f1Q60632 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nr2f1Q60632 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nr2f1Q60632 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms