Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sema5bQ60519 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sema5bQ60519 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sema5bQ60519 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sema5bQ60519 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sema5bQ60519 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Sema5bQ60519 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Sema5bQ60519 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sema5bQ60519 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Sema5bQ60519 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sema5bQ60519 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Sema5bQ60519 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema5bQ60519 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema5bQ60519 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sema5bQ60519 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema5bQ60519 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Sema5bQ60519 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema5bQ60519 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Sema5bQ60519 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema5bQ60519 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sema5bQ60519 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Sema5bQ60519 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema5bQ60519 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sema5bQ60519 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema5bQ60519 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema5bQ60519 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema5bQ60519 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema5bQ60519 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema5bQ60519 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema5bQ60519 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sema5bQ60519 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema5bQ60519 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Sema5bQ60519 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema5bQ60519 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema5bQ60519 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema5bQ60519 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sema5bQ60519 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Sema5bQ60519 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sema5bQ60519 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sema5bQ60519 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Sema5bQ60519 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema5bQ60519 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema5bQ60519 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema5bQ60519 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema5bQ60519 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema5bQ60519 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sema5bQ60519 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema5bQ60519 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sema5bQ60519 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sema5bQ60519 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sema5bQ60519 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sema5bQ60519 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sema5bQ60519 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sema5bQ60519 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sema5bQ60519 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sema5bQ60519 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Sema5bQ60519 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema5bQ60519 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema5bQ60519 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema5bQ60519 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema5bQ60519 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema5bQ60519 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema5bQ60519 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema5bQ60519 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema5bQ60519 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema5bQ60519 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sema5bQ60519 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sema5bQ60519 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Sema5bQ60519 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sema5bQ60519 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Sema5bQ60519 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sema5bQ60519 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sema5bQ60519 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sema5bQ60519 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Sema5bQ60519 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sema5bQ60519 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema5bQ60519 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema5bQ60519 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema5bQ60519 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema5bQ60519 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema5bQ60519 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema5bQ60519 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema5bQ60519 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sema5bQ60519 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema5bQ60519 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema5bQ60519 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema5bQ60519 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema5bQ60519 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema5bQ60519 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema5bQ60519 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema5bQ60519 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema5bQ60519 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema5bQ60519 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema5bQ60519 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema5bQ60519 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema5bQ60519 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema5bQ60519 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema5bQ60519 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sema5bQ60519 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sema5bQ60519 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms