Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfsf15Q5UBV8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfsf15Q5UBV8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms