Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4H9

Ncoa4, Nuclear receptor coactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa4Q5U4H9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ncoa4Q5U4H9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ncoa4Q5U4H9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ncoa4Q5U4H9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ncoa4Q5U4H9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ncoa4Q5U4H9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ncoa4Q5U4H9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ncoa4Q5U4H9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ncoa4Q5U4H9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ncoa4Q5U4H9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ncoa4Q5U4H9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ncoa4Q5U4H9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ncoa4Q5U4H9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ncoa4Q5U4H9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ncoa4Q5U4H9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ncoa4Q5U4H9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ncoa4Q5U4H9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ncoa4Q5U4H9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ncoa4Q5U4H9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ncoa4Q5U4H9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ncoa4Q5U4H9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ncoa4Q5U4H9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ncoa4Q5U4H9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ncoa4Q5U4H9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Ncoa4Q5U4H9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Ncoa4Q5U4H9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ncoa4Q5U4H9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ncoa4Q5U4H9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ncoa4Q5U4H9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Ncoa4Q5U4H9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ncoa4Q5U4H9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ncoa4Q5U4H9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Ncoa4Q5U4H9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ncoa4Q5U4H9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ncoa4Q5U4H9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ncoa4Q5U4H9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ncoa4Q5U4H9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ncoa4Q5U4H9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ncoa4Q5U4H9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ncoa4Q5U4H9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ncoa4Q5U4H9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ncoa4Q5U4H9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ncoa4Q5U4H9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ncoa4Q5U4H9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ncoa4Q5U4H9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ncoa4Q5U4H9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ncoa4Q5U4H9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ncoa4Q5U4H9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ncoa4Q5U4H9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ncoa4Q5U4H9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ncoa4Q5U4H9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ncoa4Q5U4H9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ncoa4Q5U4H9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ncoa4Q5U4H9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ncoa4Q5U4H9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ncoa4Q5U4H9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ncoa4Q5U4H9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ncoa4Q5U4H9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ncoa4Q5U4H9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ncoa4Q5U4H9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ncoa4Q5U4H9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ncoa4Q5U4H9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ncoa4Q5U4H9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ncoa4Q5U4H9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ncoa4Q5U4H9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ncoa4Q5U4H9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ncoa4Q5U4H9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ncoa4Q5U4H9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ncoa4Q5U4H9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ncoa4Q5U4H9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ncoa4Q5U4H9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ncoa4Q5U4H9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ncoa4Q5U4H9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ncoa4Q5U4H9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ncoa4Q5U4H9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ncoa4Q5U4H9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ncoa4Q5U4H9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ncoa4Q5U4H9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ncoa4Q5U4H9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ncoa4Q5U4H9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ncoa4Q5U4H9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ncoa4Q5U4H9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ncoa4Q5U4H9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ncoa4Q5U4H9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ncoa4Q5U4H9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ncoa4Q5U4H9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ncoa4Q5U4H9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ncoa4Q5U4H9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ncoa4Q5U4H9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ncoa4Q5U4H9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ncoa4Q5U4H9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ncoa4Q5U4H9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ncoa4Q5U4H9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ncoa4Q5U4H9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ncoa4Q5U4H9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ncoa4Q5U4H9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Ncoa4Q5U4H9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ncoa4Q5U4H9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ncoa4Q5U4H9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ncoa4Q5U4H9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms