Protein–RNA interactions for Protein: Q5U462

Cdcp1, CUB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdcp1Q5U462 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdcp1Q5U462 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdcp1Q5U462 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdcp1Q5U462 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdcp1Q5U462 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdcp1Q5U462 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdcp1Q5U462 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdcp1Q5U462 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdcp1Q5U462 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdcp1Q5U462 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdcp1Q5U462 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdcp1Q5U462 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdcp1Q5U462 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdcp1Q5U462 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdcp1Q5U462 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdcp1Q5U462 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdcp1Q5U462 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdcp1Q5U462 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdcp1Q5U462 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdcp1Q5U462 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdcp1Q5U462 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdcp1Q5U462 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdcp1Q5U462 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdcp1Q5U462 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdcp1Q5U462 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdcp1Q5U462 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdcp1Q5U462 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdcp1Q5U462 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdcp1Q5U462 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdcp1Q5U462 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdcp1Q5U462 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdcp1Q5U462 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdcp1Q5U462 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdcp1Q5U462 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdcp1Q5U462 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdcp1Q5U462 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdcp1Q5U462 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdcp1Q5U462 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdcp1Q5U462 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdcp1Q5U462 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdcp1Q5U462 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdcp1Q5U462 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdcp1Q5U462 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdcp1Q5U462 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdcp1Q5U462 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdcp1Q5U462 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdcp1Q5U462 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdcp1Q5U462 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdcp1Q5U462 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdcp1Q5U462 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdcp1Q5U462 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdcp1Q5U462 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdcp1Q5U462 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdcp1Q5U462 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdcp1Q5U462 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdcp1Q5U462 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdcp1Q5U462 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdcp1Q5U462 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdcp1Q5U462 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdcp1Q5U462 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdcp1Q5U462 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdcp1Q5U462 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdcp1Q5U462 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdcp1Q5U462 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdcp1Q5U462 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdcp1Q5U462 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdcp1Q5U462 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdcp1Q5U462 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdcp1Q5U462 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cdcp1Q5U462 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdcp1Q5U462 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdcp1Q5U462 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdcp1Q5U462 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdcp1Q5U462 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdcp1Q5U462 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdcp1Q5U462 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdcp1Q5U462 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdcp1Q5U462 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdcp1Q5U462 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdcp1Q5U462 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdcp1Q5U462 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdcp1Q5U462 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdcp1Q5U462 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdcp1Q5U462 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdcp1Q5U462 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdcp1Q5U462 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdcp1Q5U462 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdcp1Q5U462 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdcp1Q5U462 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdcp1Q5U462 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdcp1Q5U462 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdcp1Q5U462 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdcp1Q5U462 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdcp1Q5U462 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdcp1Q5U462 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdcp1Q5U462 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdcp1Q5U462 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdcp1Q5U462 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdcp1Q5U462 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdcp1Q5U462 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms