Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW19

Cluh, Clustered mitochondria protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluhQ5SW19 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CluhQ5SW19 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CluhQ5SW19 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CluhQ5SW19 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CluhQ5SW19 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CluhQ5SW19 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CluhQ5SW19 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CluhQ5SW19 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CluhQ5SW19 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CluhQ5SW19 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CluhQ5SW19 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CluhQ5SW19 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CluhQ5SW19 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CluhQ5SW19 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CluhQ5SW19 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CluhQ5SW19 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CluhQ5SW19 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CluhQ5SW19 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CluhQ5SW19 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CluhQ5SW19 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CluhQ5SW19 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CluhQ5SW19 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CluhQ5SW19 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CluhQ5SW19 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CluhQ5SW19 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CluhQ5SW19 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CluhQ5SW19 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CluhQ5SW19 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CluhQ5SW19 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CluhQ5SW19 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CluhQ5SW19 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CluhQ5SW19 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CluhQ5SW19 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CluhQ5SW19 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CluhQ5SW19 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CluhQ5SW19 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CluhQ5SW19 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CluhQ5SW19 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CluhQ5SW19 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CluhQ5SW19 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CluhQ5SW19 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CluhQ5SW19 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CluhQ5SW19 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CluhQ5SW19 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CluhQ5SW19 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CluhQ5SW19 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CluhQ5SW19 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CluhQ5SW19 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CluhQ5SW19 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CluhQ5SW19 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CluhQ5SW19 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CluhQ5SW19 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CluhQ5SW19 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CluhQ5SW19 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CluhQ5SW19 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CluhQ5SW19 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CluhQ5SW19 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CluhQ5SW19 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CluhQ5SW19 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CluhQ5SW19 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CluhQ5SW19 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CluhQ5SW19 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CluhQ5SW19 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CluhQ5SW19 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CluhQ5SW19 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CluhQ5SW19 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CluhQ5SW19 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CluhQ5SW19 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CluhQ5SW19 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CluhQ5SW19 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CluhQ5SW19 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CluhQ5SW19 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CluhQ5SW19 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CluhQ5SW19 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CluhQ5SW19 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CluhQ5SW19 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CluhQ5SW19 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CluhQ5SW19 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CluhQ5SW19 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CluhQ5SW19 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CluhQ5SW19 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CluhQ5SW19 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CluhQ5SW19 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CluhQ5SW19 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CluhQ5SW19 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CluhQ5SW19 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CluhQ5SW19 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CluhQ5SW19 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CluhQ5SW19 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CluhQ5SW19 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CluhQ5SW19 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CluhQ5SW19 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CluhQ5SW19 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CluhQ5SW19 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CluhQ5SW19 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CluhQ5SW19 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CluhQ5SW19 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CluhQ5SW19 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CluhQ5SW19 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CluhQ5SW19 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms