Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn1r196Q5SVD5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r196Q5SVD5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms