Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc42Q5SV66 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc42Q5SV66 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc42Q5SV66 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc42Q5SV66 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc42Q5SV66 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc42Q5SV66 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc42Q5SV66 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc42Q5SV66 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc42Q5SV66 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc42Q5SV66 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc42Q5SV66 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc42Q5SV66 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc42Q5SV66 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc42Q5SV66 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc42Q5SV66 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc42Q5SV66 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc42Q5SV66 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc42Q5SV66 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc42Q5SV66 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc42Q5SV66 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc42Q5SV66 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc42Q5SV66 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc42Q5SV66 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms