Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ankrd40Q5SUE8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ankrd40Q5SUE8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ankrd40Q5SUE8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ankrd40Q5SUE8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ankrd40Q5SUE8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ankrd40Q5SUE8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ankrd40Q5SUE8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ankrd40Q5SUE8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ankrd40Q5SUE8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ankrd40Q5SUE8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ankrd40Q5SUE8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ankrd40Q5SUE8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ankrd40Q5SUE8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ankrd40Q5SUE8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ankrd40Q5SUE8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ankrd40Q5SUE8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ankrd40Q5SUE8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ankrd40Q5SUE8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ankrd40Q5SUE8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ankrd40Q5SUE8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ankrd40Q5SUE8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ankrd40Q5SUE8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ankrd40Q5SUE8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ankrd40Q5SUE8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ankrd40Q5SUE8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ankrd40Q5SUE8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ankrd40Q5SUE8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ankrd40Q5SUE8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ankrd40Q5SUE8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ankrd40Q5SUE8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ankrd40Q5SUE8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ankrd40Q5SUE8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ankrd40Q5SUE8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ankrd40Q5SUE8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ankrd40Q5SUE8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ankrd40Q5SUE8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ankrd40Q5SUE8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ankrd40Q5SUE8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ankrd40Q5SUE8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ankrd40Q5SUE8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ankrd40Q5SUE8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ankrd40Q5SUE8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ankrd40Q5SUE8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ankrd40Q5SUE8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ankrd40Q5SUE8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ankrd40Q5SUE8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ankrd40Q5SUE8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ankrd40Q5SUE8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ankrd40Q5SUE8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms