Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc85aQ5SP85 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc85aQ5SP85 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc85aQ5SP85 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc85aQ5SP85 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc85aQ5SP85 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc85aQ5SP85 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc85aQ5SP85 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc85aQ5SP85 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc85aQ5SP85 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc85aQ5SP85 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc85aQ5SP85 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc85aQ5SP85 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc85aQ5SP85 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc85aQ5SP85 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc85aQ5SP85 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc85aQ5SP85 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc85aQ5SP85 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc85aQ5SP85 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc85aQ5SP85 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc85aQ5SP85 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc85aQ5SP85 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc85aQ5SP85 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc85aQ5SP85 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc85aQ5SP85 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc85aQ5SP85 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc85aQ5SP85 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc85aQ5SP85 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc85aQ5SP85 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc85aQ5SP85 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc85aQ5SP85 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc85aQ5SP85 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc85aQ5SP85 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc85aQ5SP85 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc85aQ5SP85 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc85aQ5SP85 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc85aQ5SP85 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc85aQ5SP85 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc85aQ5SP85 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc85aQ5SP85 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc85aQ5SP85 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc85aQ5SP85 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms