Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Trim41Q5NCC3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Trim41Q5NCC3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Trim41Q5NCC3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Trim41Q5NCC3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Trim41Q5NCC3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Trim41Q5NCC3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Trim41Q5NCC3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Trim41Q5NCC3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Trim41Q5NCC3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Trim41Q5NCC3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Trim41Q5NCC3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Trim41Q5NCC3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Trim41Q5NCC3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Trim41Q5NCC3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Trim41Q5NCC3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Trim41Q5NCC3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Trim41Q5NCC3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Trim41Q5NCC3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Trim41Q5NCC3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Trim41Q5NCC3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Trim41Q5NCC3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Trim41Q5NCC3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Trim41Q5NCC3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Trim41Q5NCC3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Trim41Q5NCC3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Trim41Q5NCC3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
Trim41Q5NCC3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Trim41Q5NCC3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Trim41Q5NCC3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Trim41Q5NCC3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Trim41Q5NCC3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Trim41Q5NCC3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Trim41Q5NCC3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Trim41Q5NCC3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Trim41Q5NCC3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Trim41Q5NCC3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Trim41Q5NCC3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Trim41Q5NCC3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Trim41Q5NCC3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Trim41Q5NCC3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Trim41Q5NCC3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Trim41Q5NCC3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Trim41Q5NCC3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
Trim41Q5NCC3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Trim41Q5NCC3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Trim41Q5NCC3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
Trim41Q5NCC3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Trim41Q5NCC3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Trim41Q5NCC3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Trim41Q5NCC3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Trim41Q5NCC3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Trim41Q5NCC3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Trim41Q5NCC3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Trim41Q5NCC3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Trim41Q5NCC3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Trim41Q5NCC3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Trim41Q5NCC3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Trim41Q5NCC3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Trim41Q5NCC3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Trim41Q5NCC3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Trim41Q5NCC3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Trim41Q5NCC3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Trim41Q5NCC3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Trim41Q5NCC3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Trim41Q5NCC3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Trim41Q5NCC3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Trim41Q5NCC3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Trim41Q5NCC3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Trim41Q5NCC3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Trim41Q5NCC3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Trim41Q5NCC3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Trim41Q5NCC3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Trim41Q5NCC3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Trim41Q5NCC3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Trim41Q5NCC3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Trim41Q5NCC3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Trim41Q5NCC3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Trim41Q5NCC3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Trim41Q5NCC3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Trim41Q5NCC3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Trim41Q5NCC3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
Trim41Q5NCC3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Trim41Q5NCC3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Trim41Q5NCC3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Trim41Q5NCC3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Trim41Q5NCC3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Trim41Q5NCC3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Trim41Q5NCC3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Trim41Q5NCC3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Trim41Q5NCC3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Trim41Q5NCC3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Trim41Q5NCC3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Trim41Q5NCC3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Trim41Q5NCC3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Trim41Q5NCC3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Trim41Q5NCC3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Trim41Q5NCC3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Trim41Q5NCC3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Trim41Q5NCC3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms