Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
1810065E05RikQ5NC41 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
1810065E05RikQ5NC41 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
1810065E05RikQ5NC41 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
1810065E05RikQ5NC41 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
1810065E05RikQ5NC41 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
1810065E05RikQ5NC41 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
1810065E05RikQ5NC41 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
1810065E05RikQ5NC41 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
1810065E05RikQ5NC41 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
1810065E05RikQ5NC41 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
1810065E05RikQ5NC41 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
1810065E05RikQ5NC41 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
1810065E05RikQ5NC41 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
1810065E05RikQ5NC41 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
1810065E05RikQ5NC41 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
1810065E05RikQ5NC41 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
1810065E05RikQ5NC41 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
1810065E05RikQ5NC41 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
1810065E05RikQ5NC41 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
1810065E05RikQ5NC41 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
1810065E05RikQ5NC41 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
1810065E05RikQ5NC41 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
1810065E05RikQ5NC41 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
1810065E05RikQ5NC41 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
1810065E05RikQ5NC41 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
1810065E05RikQ5NC41 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
1810065E05RikQ5NC41 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
1810065E05RikQ5NC41 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
1810065E05RikQ5NC41 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
1810065E05RikQ5NC41 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
1810065E05RikQ5NC41 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
1810065E05RikQ5NC41 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
1810065E05RikQ5NC41 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
1810065E05RikQ5NC41 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
1810065E05RikQ5NC41 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
1810065E05RikQ5NC41 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
1810065E05RikQ5NC41 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
1810065E05RikQ5NC41 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
1810065E05RikQ5NC41 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
1810065E05RikQ5NC41 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
1810065E05RikQ5NC41 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
1810065E05RikQ5NC41 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
1810065E05RikQ5NC41 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
1810065E05RikQ5NC41 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
1810065E05RikQ5NC41 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
1810065E05RikQ5NC41 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
1810065E05RikQ5NC41 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
1810065E05RikQ5NC41 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
1810065E05RikQ5NC41 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
1810065E05RikQ5NC41 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
1810065E05RikQ5NC41 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
1810065E05RikQ5NC41 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
1810065E05RikQ5NC41 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
1810065E05RikQ5NC41 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
1810065E05RikQ5NC41 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
1810065E05RikQ5NC41 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
1810065E05RikQ5NC41 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
1810065E05RikQ5NC41 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
1810065E05RikQ5NC41 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
1810065E05RikQ5NC41 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
1810065E05RikQ5NC41 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
1810065E05RikQ5NC41 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
1810065E05RikQ5NC41 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
1810065E05RikQ5NC41 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
1810065E05RikQ5NC41 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
1810065E05RikQ5NC41 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
1810065E05RikQ5NC41 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
1810065E05RikQ5NC41 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
1810065E05RikQ5NC41 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
1810065E05RikQ5NC41 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
1810065E05RikQ5NC41 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
1810065E05RikQ5NC41 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
1810065E05RikQ5NC41 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
1810065E05RikQ5NC41 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
1810065E05RikQ5NC41 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
1810065E05RikQ5NC41 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
1810065E05RikQ5NC41 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
1810065E05RikQ5NC41 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
1810065E05RikQ5NC41 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
1810065E05RikQ5NC41 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
1810065E05RikQ5NC41 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
1810065E05RikQ5NC41 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
1810065E05RikQ5NC41 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
1810065E05RikQ5NC41 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
1810065E05RikQ5NC41 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
1810065E05RikQ5NC41 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
1810065E05RikQ5NC41 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
1810065E05RikQ5NC41 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
1810065E05RikQ5NC41 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
1810065E05RikQ5NC41 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
1810065E05RikQ5NC41 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
1810065E05RikQ5NC41 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
1810065E05RikQ5NC41 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
1810065E05RikQ5NC41 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
1810065E05RikQ5NC41 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
1810065E05RikQ5NC41 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
1810065E05RikQ5NC41 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
1810065E05RikQ5NC41 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
1810065E05RikQ5NC41 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms