Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKP2

Usp13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp13Q5BKP2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp13Q5BKP2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp13Q5BKP2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp13Q5BKP2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp13Q5BKP2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp13Q5BKP2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp13Q5BKP2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp13Q5BKP2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Usp13Q5BKP2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Usp13Q5BKP2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp13Q5BKP2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms