Protein–RNA interactions for Protein: Q58A65

Spag9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spag9Q58A65 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Spag9Q58A65 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Spag9Q58A65 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Spag9Q58A65 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Spag9Q58A65 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Spag9Q58A65 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Spag9Q58A65 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Spag9Q58A65 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Spag9Q58A65 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Spag9Q58A65 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Spag9Q58A65 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Spag9Q58A65 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Spag9Q58A65 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Spag9Q58A65 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Spag9Q58A65 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Spag9Q58A65 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Spag9Q58A65 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Spag9Q58A65 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Spag9Q58A65 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Spag9Q58A65 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Spag9Q58A65 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Spag9Q58A65 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Spag9Q58A65 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Spag9Q58A65 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Spag9Q58A65 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Spag9Q58A65 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Spag9Q58A65 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Spag9Q58A65 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Spag9Q58A65 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Spag9Q58A65 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Spag9Q58A65 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Spag9Q58A65 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Spag9Q58A65 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Spag9Q58A65 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Spag9Q58A65 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Spag9Q58A65 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Spag9Q58A65 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Spag9Q58A65 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Spag9Q58A65 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Spag9Q58A65 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Spag9Q58A65 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Spag9Q58A65 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Spag9Q58A65 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Spag9Q58A65 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Spag9Q58A65 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Spag9Q58A65 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Spag9Q58A65 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Spag9Q58A65 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Spag9Q58A65 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Spag9Q58A65 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Spag9Q58A65 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Spag9Q58A65 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Spag9Q58A65 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Spag9Q58A65 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Spag9Q58A65 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Spag9Q58A65 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Spag9Q58A65 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Spag9Q58A65 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Spag9Q58A65 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Spag9Q58A65 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Spag9Q58A65 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Spag9Q58A65 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Spag9Q58A65 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Spag9Q58A65 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Spag9Q58A65 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Spag9Q58A65 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Spag9Q58A65 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Spag9Q58A65 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Spag9Q58A65 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Spag9Q58A65 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Spag9Q58A65 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Spag9Q58A65 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Spag9Q58A65 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Spag9Q58A65 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Spag9Q58A65 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Spag9Q58A65 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Spag9Q58A65 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Spag9Q58A65 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Spag9Q58A65 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Spag9Q58A65 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Spag9Q58A65 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Spag9Q58A65 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Spag9Q58A65 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Spag9Q58A65 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Spag9Q58A65 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Spag9Q58A65 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Spag9Q58A65 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Spag9Q58A65 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Spag9Q58A65 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Spag9Q58A65 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Spag9Q58A65 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Spag9Q58A65 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Spag9Q58A65 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Spag9Q58A65 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Spag9Q58A65 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Spag9Q58A65 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Spag9Q58A65 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Spag9Q58A65 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Spag9Q58A65 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Spag9Q58A65 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms