Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Znf608Q56A10 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Znf608Q56A10 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Znf608Q56A10 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Znf608Q56A10 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Znf608Q56A10 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Znf608Q56A10 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Znf608Q56A10 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Znf608Q56A10 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Znf608Q56A10 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Znf608Q56A10 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Znf608Q56A10 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Znf608Q56A10 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Znf608Q56A10 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Znf608Q56A10 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Znf608Q56A10 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Znf608Q56A10 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Znf608Q56A10 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Znf608Q56A10 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Znf608Q56A10 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Znf608Q56A10 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Znf608Q56A10 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Znf608Q56A10 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Znf608Q56A10 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Znf608Q56A10 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Znf608Q56A10 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Znf608Q56A10 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Znf608Q56A10 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Znf608Q56A10 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Znf608Q56A10 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Znf608Q56A10 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Znf608Q56A10 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Znf608Q56A10 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Znf608Q56A10 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Znf608Q56A10 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Znf608Q56A10 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Znf608Q56A10 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Znf608Q56A10 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Znf608Q56A10 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Znf608Q56A10 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Znf608Q56A10 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Znf608Q56A10 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Znf608Q56A10 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Znf608Q56A10 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Znf608Q56A10 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Znf608Q56A10 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Znf608Q56A10 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Znf608Q56A10 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Znf608Q56A10 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Znf608Q56A10 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Znf608Q56A10 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Znf608Q56A10 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Znf608Q56A10 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Znf608Q56A10 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Znf608Q56A10 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Znf608Q56A10 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Znf608Q56A10 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Znf608Q56A10 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Znf608Q56A10 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Znf608Q56A10 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Znf608Q56A10 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Znf608Q56A10 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Znf608Q56A10 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Znf608Q56A10 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Znf608Q56A10 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Znf608Q56A10 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Znf608Q56A10 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Znf608Q56A10 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Znf608Q56A10 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Znf608Q56A10 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Znf608Q56A10 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Znf608Q56A10 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Znf608Q56A10 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Znf608Q56A10 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Znf608Q56A10 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Znf608Q56A10 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Znf608Q56A10 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Znf608Q56A10 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Znf608Q56A10 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Znf608Q56A10 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Znf608Q56A10 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Znf608Q56A10 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Znf608Q56A10 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Znf608Q56A10 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Znf608Q56A10 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Znf608Q56A10 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Znf608Q56A10 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Znf608Q56A10 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Znf608Q56A10 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Znf608Q56A10 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Znf608Q56A10 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Znf608Q56A10 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Znf608Q56A10 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Znf608Q56A10 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Znf608Q56A10 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Znf608Q56A10 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Znf608Q56A10 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Znf608Q56A10 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Znf608Q56A10 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Znf608Q56A10 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms