Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR3

Prune2, Protein prune homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune2Q52KR3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prune2Q52KR3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prune2Q52KR3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prune2Q52KR3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prune2Q52KR3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prune2Q52KR3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prune2Q52KR3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prune2Q52KR3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prune2Q52KR3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prune2Q52KR3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prune2Q52KR3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prune2Q52KR3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prune2Q52KR3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prune2Q52KR3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prune2Q52KR3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prune2Q52KR3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prune2Q52KR3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prune2Q52KR3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prune2Q52KR3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prune2Q52KR3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prune2Q52KR3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prune2Q52KR3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prune2Q52KR3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prune2Q52KR3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prune2Q52KR3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prune2Q52KR3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prune2Q52KR3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prune2Q52KR3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prune2Q52KR3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prune2Q52KR3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prune2Q52KR3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prune2Q52KR3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prune2Q52KR3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prune2Q52KR3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Prune2Q52KR3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prune2Q52KR3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prune2Q52KR3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms