Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccnl1Q52KE7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccnl1Q52KE7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccnl1Q52KE7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccnl1Q52KE7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccnl1Q52KE7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccnl1Q52KE7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccnl1Q52KE7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccnl1Q52KE7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccnl1Q52KE7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccnl1Q52KE7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccnl1Q52KE7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccnl1Q52KE7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccnl1Q52KE7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccnl1Q52KE7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccnl1Q52KE7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccnl1Q52KE7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccnl1Q52KE7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccnl1Q52KE7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccnl1Q52KE7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccnl1Q52KE7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccnl1Q52KE7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccnl1Q52KE7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccnl1Q52KE7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccnl1Q52KE7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccnl1Q52KE7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccnl1Q52KE7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccnl1Q52KE7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccnl1Q52KE7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccnl1Q52KE7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccnl1Q52KE7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccnl1Q52KE7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccnl1Q52KE7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccnl1Q52KE7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccnl1Q52KE7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccnl1Q52KE7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccnl1Q52KE7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccnl1Q52KE7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccnl1Q52KE7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccnl1Q52KE7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccnl1Q52KE7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccnl1Q52KE7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccnl1Q52KE7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccnl1Q52KE7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccnl1Q52KE7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccnl1Q52KE7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccnl1Q52KE7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccnl1Q52KE7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccnl1Q52KE7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccnl1Q52KE7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccnl1Q52KE7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccnl1Q52KE7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccnl1Q52KE7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccnl1Q52KE7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccnl1Q52KE7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccnl1Q52KE7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccnl1Q52KE7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccnl1Q52KE7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccnl1Q52KE7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccnl1Q52KE7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccnl1Q52KE7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccnl1Q52KE7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccnl1Q52KE7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccnl1Q52KE7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccnl1Q52KE7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccnl1Q52KE7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccnl1Q52KE7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccnl1Q52KE7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccnl1Q52KE7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccnl1Q52KE7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccnl1Q52KE7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccnl1Q52KE7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccnl1Q52KE7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccnl1Q52KE7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccnl1Q52KE7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccnl1Q52KE7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccnl1Q52KE7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccnl1Q52KE7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccnl1Q52KE7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccnl1Q52KE7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccnl1Q52KE7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccnl1Q52KE7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccnl1Q52KE7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccnl1Q52KE7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccnl1Q52KE7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccnl1Q52KE7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccnl1Q52KE7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccnl1Q52KE7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccnl1Q52KE7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccnl1Q52KE7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccnl1Q52KE7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccnl1Q52KE7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccnl1Q52KE7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccnl1Q52KE7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccnl1Q52KE7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccnl1Q52KE7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccnl1Q52KE7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccnl1Q52KE7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccnl1Q52KE7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccnl1Q52KE7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms