Protein–RNA interactions for Protein: Q505D7

Opa3, Optic atrophy 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opa3Q505D7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Opa3Q505D7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Opa3Q505D7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Opa3Q505D7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Opa3Q505D7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Opa3Q505D7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Opa3Q505D7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Opa3Q505D7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Opa3Q505D7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Opa3Q505D7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Opa3Q505D7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Opa3Q505D7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Opa3Q505D7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Opa3Q505D7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Opa3Q505D7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Opa3Q505D7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Opa3Q505D7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Opa3Q505D7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Opa3Q505D7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Opa3Q505D7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Opa3Q505D7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Opa3Q505D7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Opa3Q505D7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Opa3Q505D7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Opa3Q505D7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Opa3Q505D7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Opa3Q505D7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Opa3Q505D7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Opa3Q505D7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms