Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc84Q4VA36 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc84Q4VA36 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc84Q4VA36 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc84Q4VA36 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc84Q4VA36 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc84Q4VA36 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc84Q4VA36 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc84Q4VA36 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc84Q4VA36 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc84Q4VA36 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc84Q4VA36 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc84Q4VA36 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc84Q4VA36 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc84Q4VA36 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc84Q4VA36 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc84Q4VA36 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc84Q4VA36 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc84Q4VA36 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc84Q4VA36 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc84Q4VA36 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc84Q4VA36 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc84Q4VA36 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc84Q4VA36 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc84Q4VA36 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc84Q4VA36 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc84Q4VA36 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc84Q4VA36 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc84Q4VA36 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc84Q4VA36 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc84Q4VA36 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc84Q4VA36 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc84Q4VA36 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc84Q4VA36 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc84Q4VA36 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc84Q4VA36 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc84Q4VA36 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc84Q4VA36 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc84Q4VA36 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc84Q4VA36 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc84Q4VA36 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc84Q4VA36 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc84Q4VA36 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc84Q4VA36 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc84Q4VA36 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc84Q4VA36 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc84Q4VA36 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc84Q4VA36 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc84Q4VA36 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc84Q4VA36 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc84Q4VA36 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc84Q4VA36 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc84Q4VA36 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc84Q4VA36 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc84Q4VA36 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms