Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Xirp2Q4U4S6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Xirp2Q4U4S6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Xirp2Q4U4S6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Xirp2Q4U4S6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Xirp2Q4U4S6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Xirp2Q4U4S6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Xirp2Q4U4S6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Xirp2Q4U4S6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Xirp2Q4U4S6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Xirp2Q4U4S6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Xirp2Q4U4S6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Xirp2Q4U4S6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms