Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL20

Obox7, MCG6337, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox7Q4KL20 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Obox7Q4KL20 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Obox7Q4KL20 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Obox7Q4KL20 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Obox7Q4KL20 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Obox7Q4KL20 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Obox7Q4KL20 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Obox7Q4KL20 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Obox7Q4KL20 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Obox7Q4KL20 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Obox7Q4KL20 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Obox7Q4KL20 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Obox7Q4KL20 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Obox7Q4KL20 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Obox7Q4KL20 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Obox7Q4KL20 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Obox7Q4KL20 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Obox7Q4KL20 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Obox7Q4KL20 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Obox7Q4KL20 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Obox7Q4KL20 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Obox7Q4KL20 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Obox7Q4KL20 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Obox7Q4KL20 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Obox7Q4KL20 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms