Protein–RNA interactions for Protein: Q3V460

Smim26, Gene model 561, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim26Q3V460 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim26Q3V460 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim26Q3V460 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim26Q3V460 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim26Q3V460 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim26Q3V460 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim26Q3V460 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim26Q3V460 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim26Q3V460 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim26Q3V460 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim26Q3V460 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim26Q3V460 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim26Q3V460 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim26Q3V460 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim26Q3V460 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim26Q3V460 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim26Q3V460 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Smim26Q3V460 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim26Q3V460 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms