Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X1

Smim9, Small integral membrane protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim9Q3V0X1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Smim9Q3V0X1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smim9Q3V0X1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smim9Q3V0X1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Smim9Q3V0X1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smim9Q3V0X1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smim9Q3V0X1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smim9Q3V0X1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim9Q3V0X1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim9Q3V0X1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Smim9Q3V0X1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim9Q3V0X1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim9Q3V0X1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim9Q3V0X1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim9Q3V0X1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smim9Q3V0X1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim9Q3V0X1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim9Q3V0X1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim9Q3V0X1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smim9Q3V0X1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smim9Q3V0X1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim9Q3V0X1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim9Q3V0X1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smim9Q3V0X1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim9Q3V0X1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim9Q3V0X1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smim9Q3V0X1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smim9Q3V0X1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smim9Q3V0X1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Smim9Q3V0X1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim9Q3V0X1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smim9Q3V0X1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim9Q3V0X1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Smim9Q3V0X1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim9Q3V0X1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smim9Q3V0X1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim9Q3V0X1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim9Q3V0X1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Smim9Q3V0X1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim9Q3V0X1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smim9Q3V0X1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim9Q3V0X1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim9Q3V0X1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smim9Q3V0X1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim9Q3V0X1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim9Q3V0X1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim9Q3V0X1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smim9Q3V0X1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim9Q3V0X1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim9Q3V0X1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Smim9Q3V0X1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim9Q3V0X1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim9Q3V0X1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smim9Q3V0X1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smim9Q3V0X1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smim9Q3V0X1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smim9Q3V0X1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smim9Q3V0X1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms