Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrrc43Q3V0L5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrrc43Q3V0L5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrrc43Q3V0L5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrrc43Q3V0L5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrrc43Q3V0L5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrrc43Q3V0L5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrrc43Q3V0L5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrrc43Q3V0L5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrrc43Q3V0L5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrc43Q3V0L5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrc43Q3V0L5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrc43Q3V0L5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrc43Q3V0L5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrc43Q3V0L5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrc43Q3V0L5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrc43Q3V0L5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrc43Q3V0L5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrc43Q3V0L5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrc43Q3V0L5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrc43Q3V0L5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrc43Q3V0L5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrc43Q3V0L5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrc43Q3V0L5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrc43Q3V0L5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrc43Q3V0L5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrc43Q3V0L5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrc43Q3V0L5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrc43Q3V0L5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrc43Q3V0L5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrc43Q3V0L5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrc43Q3V0L5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrc43Q3V0L5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrc43Q3V0L5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrc43Q3V0L5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrc43Q3V0L5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrc43Q3V0L5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrc43Q3V0L5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrc43Q3V0L5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrc43Q3V0L5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrc43Q3V0L5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrc43Q3V0L5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrc43Q3V0L5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrc43Q3V0L5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrc43Q3V0L5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrc43Q3V0L5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrc43Q3V0L5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrc43Q3V0L5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrc43Q3V0L5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrc43Q3V0L5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrc43Q3V0L5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrc43Q3V0L5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrc43Q3V0L5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lrrc43Q3V0L5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrc43Q3V0L5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrc43Q3V0L5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrc43Q3V0L5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrc43Q3V0L5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrc43Q3V0L5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrc43Q3V0L5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrc43Q3V0L5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrc43Q3V0L5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrc43Q3V0L5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrc43Q3V0L5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrc43Q3V0L5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrc43Q3V0L5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrc43Q3V0L5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrc43Q3V0L5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrc43Q3V0L5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrc43Q3V0L5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrc43Q3V0L5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrc43Q3V0L5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrc43Q3V0L5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrc43Q3V0L5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrc43Q3V0L5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrc43Q3V0L5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrc43Q3V0L5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrc43Q3V0L5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrc43Q3V0L5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrc43Q3V0L5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrc43Q3V0L5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrc43Q3V0L5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrc43Q3V0L5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrc43Q3V0L5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrc43Q3V0L5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrc43Q3V0L5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrc43Q3V0L5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrc43Q3V0L5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrc43Q3V0L5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrc43Q3V0L5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrc43Q3V0L5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrc43Q3V0L5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrc43Q3V0L5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrc43Q3V0L5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrc43Q3V0L5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrc43Q3V0L5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrc43Q3V0L5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrc43Q3V0L5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrc43Q3V0L5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrc43Q3V0L5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
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