Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0F0

Rimbp3, RIMS-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rimbp3Q3V0F0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rimbp3Q3V0F0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Rimbp3Q3V0F0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rimbp3Q3V0F0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rimbp3Q3V0F0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rimbp3Q3V0F0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rimbp3Q3V0F0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rimbp3Q3V0F0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rimbp3Q3V0F0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rimbp3Q3V0F0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rimbp3Q3V0F0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rimbp3Q3V0F0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rimbp3Q3V0F0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rimbp3Q3V0F0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rimbp3Q3V0F0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rimbp3Q3V0F0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rimbp3Q3V0F0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rimbp3Q3V0F0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rimbp3Q3V0F0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Rimbp3Q3V0F0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rimbp3Q3V0F0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rimbp3Q3V0F0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rimbp3Q3V0F0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rimbp3Q3V0F0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rimbp3Q3V0F0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Rimbp3Q3V0F0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rimbp3Q3V0F0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rimbp3Q3V0F0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Rimbp3Q3V0F0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rimbp3Q3V0F0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rimbp3Q3V0F0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rimbp3Q3V0F0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rimbp3Q3V0F0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Rimbp3Q3V0F0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rimbp3Q3V0F0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rimbp3Q3V0F0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rimbp3Q3V0F0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rimbp3Q3V0F0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rimbp3Q3V0F0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rimbp3Q3V0F0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rimbp3Q3V0F0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rimbp3Q3V0F0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rimbp3Q3V0F0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rimbp3Q3V0F0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Rimbp3Q3V0F0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rimbp3Q3V0F0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rimbp3Q3V0F0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rimbp3Q3V0F0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rimbp3Q3V0F0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rimbp3Q3V0F0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rimbp3Q3V0F0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Rimbp3Q3V0F0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rimbp3Q3V0F0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rimbp3Q3V0F0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rimbp3Q3V0F0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Rimbp3Q3V0F0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rimbp3Q3V0F0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rimbp3Q3V0F0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rimbp3Q3V0F0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rimbp3Q3V0F0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rimbp3Q3V0F0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rimbp3Q3V0F0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rimbp3Q3V0F0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rimbp3Q3V0F0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rimbp3Q3V0F0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rimbp3Q3V0F0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rimbp3Q3V0F0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rimbp3Q3V0F0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rimbp3Q3V0F0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rimbp3Q3V0F0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rimbp3Q3V0F0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rimbp3Q3V0F0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rimbp3Q3V0F0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rimbp3Q3V0F0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Rimbp3Q3V0F0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rimbp3Q3V0F0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rimbp3Q3V0F0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rimbp3Q3V0F0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rimbp3Q3V0F0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rimbp3Q3V0F0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rimbp3Q3V0F0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rimbp3Q3V0F0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rimbp3Q3V0F0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rimbp3Q3V0F0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rimbp3Q3V0F0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rimbp3Q3V0F0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rimbp3Q3V0F0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rimbp3Q3V0F0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rimbp3Q3V0F0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rimbp3Q3V0F0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rimbp3Q3V0F0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rimbp3Q3V0F0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rimbp3Q3V0F0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rimbp3Q3V0F0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rimbp3Q3V0F0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rimbp3Q3V0F0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rimbp3Q3V0F0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Rimbp3Q3V0F0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rimbp3Q3V0F0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Rimbp3Q3V0F0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms