Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc27Q3V036 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc27Q3V036 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc27Q3V036 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc27Q3V036 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc27Q3V036 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc27Q3V036 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc27Q3V036 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc27Q3V036 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc27Q3V036 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc27Q3V036 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc27Q3V036 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc27Q3V036 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc27Q3V036 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc27Q3V036 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc27Q3V036 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc27Q3V036 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc27Q3V036 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc27Q3V036 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc27Q3V036 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc27Q3V036 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc27Q3V036 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc27Q3V036 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc27Q3V036 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc27Q3V036 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc27Q3V036 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc27Q3V036 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc27Q3V036 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc27Q3V036 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc27Q3V036 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc27Q3V036 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc27Q3V036 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc27Q3V036 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc27Q3V036 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc27Q3V036 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc27Q3V036 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc27Q3V036 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc27Q3V036 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc27Q3V036 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc27Q3V036 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc27Q3V036 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc27Q3V036 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc27Q3V036 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms