Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnpc3Q3UZ01 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnpc3Q3UZ01 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms