Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV8

Dnaaf3, Dynein assembly factor 3, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf3Q3UYV8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnaaf3Q3UYV8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dnaaf3Q3UYV8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms