Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr1d1Q3UV55 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr1d1Q3UV55 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr1d1Q3UV55 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr1d1Q3UV55 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr1d1Q3UV55 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr1d1Q3UV55 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr1d1Q3UV55 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr1d1Q3UV55 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr1d1Q3UV55 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr1d1Q3UV55 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr1d1Q3UV55 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nr1d1Q3UV55 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr1d1Q3UV55 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr1d1Q3UV55 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr1d1Q3UV55 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr1d1Q3UV55 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr1d1Q3UV55 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr1d1Q3UV55 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr1d1Q3UV55 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr1d1Q3UV55 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr1d1Q3UV55 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr1d1Q3UV55 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr1d1Q3UV55 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr1d1Q3UV55 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nr1d1Q3UV55 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr1d1Q3UV55 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr1d1Q3UV55 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr1d1Q3UV55 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr1d1Q3UV55 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr1d1Q3UV55 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr1d1Q3UV55 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nr1d1Q3UV55 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nr1d1Q3UV55 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nr1d1Q3UV55 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nr1d1Q3UV55 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nr1d1Q3UV55 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nr1d1Q3UV55 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nr1d1Q3UV55 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nr1d1Q3UV55 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nr1d1Q3UV55 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nr1d1Q3UV55 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nr1d1Q3UV55 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nr1d1Q3UV55 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nr1d1Q3UV55 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nr1d1Q3UV55 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Nr1d1Q3UV55 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nr1d1Q3UV55 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nr1d1Q3UV55 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nr1d1Q3UV55 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nr1d1Q3UV55 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms