Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUY6

Prom2, Prominin-2, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prom2Q3UUY6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prom2Q3UUY6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prom2Q3UUY6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prom2Q3UUY6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prom2Q3UUY6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prom2Q3UUY6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prom2Q3UUY6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prom2Q3UUY6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prom2Q3UUY6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prom2Q3UUY6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prom2Q3UUY6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prom2Q3UUY6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Prom2Q3UUY6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Prom2Q3UUY6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prom2Q3UUY6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prom2Q3UUY6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prom2Q3UUY6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prom2Q3UUY6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Prom2Q3UUY6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prom2Q3UUY6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prom2Q3UUY6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prom2Q3UUY6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prom2Q3UUY6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Prom2Q3UUY6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prom2Q3UUY6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prom2Q3UUY6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prom2Q3UUY6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prom2Q3UUY6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prom2Q3UUY6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prom2Q3UUY6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prom2Q3UUY6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prom2Q3UUY6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prom2Q3UUY6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prom2Q3UUY6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prom2Q3UUY6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prom2Q3UUY6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prom2Q3UUY6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prom2Q3UUY6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prom2Q3UUY6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Prom2Q3UUY6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prom2Q3UUY6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prom2Q3UUY6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prom2Q3UUY6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prom2Q3UUY6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prom2Q3UUY6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prom2Q3UUY6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prom2Q3UUY6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prom2Q3UUY6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prom2Q3UUY6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prom2Q3UUY6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prom2Q3UUY6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Prom2Q3UUY6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prom2Q3UUY6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prom2Q3UUY6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prom2Q3UUY6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prom2Q3UUY6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prom2Q3UUY6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prom2Q3UUY6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prom2Q3UUY6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prom2Q3UUY6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prom2Q3UUY6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prom2Q3UUY6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prom2Q3UUY6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prom2Q3UUY6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prom2Q3UUY6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prom2Q3UUY6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prom2Q3UUY6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Prom2Q3UUY6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Prom2Q3UUY6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Prom2Q3UUY6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Prom2Q3UUY6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prom2Q3UUY6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prom2Q3UUY6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prom2Q3UUY6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Prom2Q3UUY6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prom2Q3UUY6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prom2Q3UUY6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prom2Q3UUY6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prom2Q3UUY6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prom2Q3UUY6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prom2Q3UUY6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Prom2Q3UUY6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prom2Q3UUY6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prom2Q3UUY6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prom2Q3UUY6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prom2Q3UUY6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prom2Q3UUY6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prom2Q3UUY6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prom2Q3UUY6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prom2Q3UUY6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prom2Q3UUY6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prom2Q3UUY6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prom2Q3UUY6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Prom2Q3UUY6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prom2Q3UUY6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prom2Q3UUY6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prom2Q3UUY6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prom2Q3UUY6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prom2Q3UUY6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prom2Q3UUY6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms