Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chpf2Q3UU43 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chpf2Q3UU43 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chpf2Q3UU43 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chpf2Q3UU43 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chpf2Q3UU43 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chpf2Q3UU43 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chpf2Q3UU43 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chpf2Q3UU43 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chpf2Q3UU43 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chpf2Q3UU43 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chpf2Q3UU43 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chpf2Q3UU43 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chpf2Q3UU43 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chpf2Q3UU43 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chpf2Q3UU43 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chpf2Q3UU43 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chpf2Q3UU43 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Chpf2Q3UU43 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chpf2Q3UU43 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chpf2Q3UU43 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chpf2Q3UU43 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chpf2Q3UU43 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chpf2Q3UU43 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chpf2Q3UU43 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chpf2Q3UU43 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chpf2Q3UU43 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chpf2Q3UU43 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chpf2Q3UU43 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chpf2Q3UU43 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chpf2Q3UU43 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chpf2Q3UU43 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chpf2Q3UU43 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chpf2Q3UU43 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chpf2Q3UU43 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chpf2Q3UU43 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chpf2Q3UU43 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chpf2Q3UU43 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chpf2Q3UU43 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chpf2Q3UU43 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chpf2Q3UU43 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chpf2Q3UU43 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chpf2Q3UU43 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chpf2Q3UU43 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chpf2Q3UU43 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chpf2Q3UU43 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Chpf2Q3UU43 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chpf2Q3UU43 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chpf2Q3UU43 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chpf2Q3UU43 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chpf2Q3UU43 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chpf2Q3UU43 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chpf2Q3UU43 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chpf2Q3UU43 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chpf2Q3UU43 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chpf2Q3UU43 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chpf2Q3UU43 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chpf2Q3UU43 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chpf2Q3UU43 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chpf2Q3UU43 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chpf2Q3UU43 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chpf2Q3UU43 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chpf2Q3UU43 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chpf2Q3UU43 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chpf2Q3UU43 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chpf2Q3UU43 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chpf2Q3UU43 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chpf2Q3UU43 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chpf2Q3UU43 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chpf2Q3UU43 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chpf2Q3UU43 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chpf2Q3UU43 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chpf2Q3UU43 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chpf2Q3UU43 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chpf2Q3UU43 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chpf2Q3UU43 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chpf2Q3UU43 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chpf2Q3UU43 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chpf2Q3UU43 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chpf2Q3UU43 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chpf2Q3UU43 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chpf2Q3UU43 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chpf2Q3UU43 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chpf2Q3UU43 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chpf2Q3UU43 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chpf2Q3UU43 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chpf2Q3UU43 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chpf2Q3UU43 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Chpf2Q3UU43 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chpf2Q3UU43 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chpf2Q3UU43 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chpf2Q3UU43 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chpf2Q3UU43 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chpf2Q3UU43 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Chpf2Q3UU43 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Chpf2Q3UU43 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Chpf2Q3UU43 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Chpf2Q3UU43 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Chpf2Q3UU43 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Chpf2Q3UU43 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms