Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTQ8

Cdkl5, Cyclin-dependent kinase-like 5, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl5Q3UTQ8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdkl5Q3UTQ8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdkl5Q3UTQ8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdkl5Q3UTQ8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdkl5Q3UTQ8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdkl5Q3UTQ8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdkl5Q3UTQ8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdkl5Q3UTQ8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdkl5Q3UTQ8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdkl5Q3UTQ8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdkl5Q3UTQ8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdkl5Q3UTQ8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdkl5Q3UTQ8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdkl5Q3UTQ8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdkl5Q3UTQ8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdkl5Q3UTQ8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdkl5Q3UTQ8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdkl5Q3UTQ8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdkl5Q3UTQ8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdkl5Q3UTQ8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdkl5Q3UTQ8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdkl5Q3UTQ8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdkl5Q3UTQ8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdkl5Q3UTQ8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms