Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klhdc9Q3USL1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klhdc9Q3USL1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klhdc9Q3USL1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klhdc9Q3USL1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klhdc9Q3USL1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klhdc9Q3USL1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klhdc9Q3USL1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klhdc9Q3USL1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Klhdc9Q3USL1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klhdc9Q3USL1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klhdc9Q3USL1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klhdc9Q3USL1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klhdc9Q3USL1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klhdc9Q3USL1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klhdc9Q3USL1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Klhdc9Q3USL1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klhdc9Q3USL1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klhdc9Q3USL1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klhdc9Q3USL1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klhdc9Q3USL1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klhdc9Q3USL1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klhdc9Q3USL1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klhdc9Q3USL1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klhdc9Q3USL1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Klhdc9Q3USL1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klhdc9Q3USL1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Klhdc9Q3USL1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klhdc9Q3USL1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klhdc9Q3USL1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Klhdc9Q3USL1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klhdc9Q3USL1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klhdc9Q3USL1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klhdc9Q3USL1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Klhdc9Q3USL1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klhdc9Q3USL1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klhdc9Q3USL1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klhdc9Q3USL1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klhdc9Q3USL1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klhdc9Q3USL1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klhdc9Q3USL1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Klhdc9Q3USL1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Klhdc9Q3USL1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klhdc9Q3USL1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Klhdc9Q3USL1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klhdc9Q3USL1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klhdc9Q3USL1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klhdc9Q3USL1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klhdc9Q3USL1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Klhdc9Q3USL1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klhdc9Q3USL1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klhdc9Q3USL1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klhdc9Q3USL1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Klhdc9Q3USL1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klhdc9Q3USL1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klhdc9Q3USL1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Klhdc9Q3USL1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klhdc9Q3USL1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klhdc9Q3USL1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klhdc9Q3USL1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klhdc9Q3USL1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klhdc9Q3USL1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klhdc9Q3USL1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Klhdc9Q3USL1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klhdc9Q3USL1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klhdc9Q3USL1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Klhdc9Q3USL1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klhdc9Q3USL1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klhdc9Q3USL1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klhdc9Q3USL1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klhdc9Q3USL1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Klhdc9Q3USL1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klhdc9Q3USL1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klhdc9Q3USL1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klhdc9Q3USL1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klhdc9Q3USL1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klhdc9Q3USL1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klhdc9Q3USL1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klhdc9Q3USL1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Klhdc9Q3USL1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Klhdc9Q3USL1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Klhdc9Q3USL1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Klhdc9Q3USL1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Klhdc9Q3USL1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Klhdc9Q3USL1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Klhdc9Q3USL1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Klhdc9Q3USL1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Klhdc9Q3USL1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Klhdc9Q3USL1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Klhdc9Q3USL1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Klhdc9Q3USL1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Klhdc9Q3USL1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Klhdc9Q3USL1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Klhdc9Q3USL1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Klhdc9Q3USL1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Klhdc9Q3USL1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Klhdc9Q3USL1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klhdc9Q3USL1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klhdc9Q3USL1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Klhdc9Q3USL1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms