Protein–RNA interactions for Protein: Q3URS9

Ccdc51, Coiled-coil domain-containing protein 51, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc51Q3URS9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc51Q3URS9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc51Q3URS9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc51Q3URS9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc51Q3URS9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc51Q3URS9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc51Q3URS9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc51Q3URS9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc51Q3URS9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc51Q3URS9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc51Q3URS9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc51Q3URS9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc51Q3URS9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc51Q3URS9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc51Q3URS9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc51Q3URS9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc51Q3URS9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc51Q3URS9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc51Q3URS9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc51Q3URS9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc51Q3URS9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc51Q3URS9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc51Q3URS9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc51Q3URS9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc51Q3URS9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc51Q3URS9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc51Q3URS9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc51Q3URS9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc51Q3URS9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc51Q3URS9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc51Q3URS9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc51Q3URS9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc51Q3URS9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc51Q3URS9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc51Q3URS9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc51Q3URS9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc51Q3URS9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc51Q3URS9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc51Q3URS9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc51Q3URS9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc51Q3URS9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc51Q3URS9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc51Q3URS9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc51Q3URS9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc51Q3URS9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc51Q3URS9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc51Q3URS9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc51Q3URS9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc51Q3URS9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc51Q3URS9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc51Q3URS9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc51Q3URS9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc51Q3URS9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc51Q3URS9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc51Q3URS9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc51Q3URS9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc51Q3URS9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc51Q3URS9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc51Q3URS9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc51Q3URS9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc51Q3URS9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc51Q3URS9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc51Q3URS9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc51Q3URS9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc51Q3URS9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc51Q3URS9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc51Q3URS9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc51Q3URS9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc51Q3URS9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc51Q3URS9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc51Q3URS9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc51Q3URS9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc51Q3URS9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc51Q3URS9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc51Q3URS9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc51Q3URS9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc51Q3URS9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc51Q3URS9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc51Q3URS9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc51Q3URS9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc51Q3URS9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc51Q3URS9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc51Q3URS9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc51Q3URS9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc51Q3URS9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc51Q3URS9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc51Q3URS9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc51Q3URS9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc51Q3URS9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc51Q3URS9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc51Q3URS9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc51Q3URS9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc51Q3URS9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc51Q3URS9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc51Q3URS9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc51Q3URS9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc51Q3URS9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc51Q3URS9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc51Q3URS9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc51Q3URS9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms