Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem253Q3UNB8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem253Q3UNB8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem253Q3UNB8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem253Q3UNB8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem253Q3UNB8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem253Q3UNB8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem253Q3UNB8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem253Q3UNB8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem253Q3UNB8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Tmem253Q3UNB8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem253Q3UNB8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem253Q3UNB8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem253Q3UNB8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Tmem253Q3UNB8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Tmem253Q3UNB8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem253Q3UNB8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem253Q3UNB8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Tmem253Q3UNB8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem253Q3UNB8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem253Q3UNB8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem253Q3UNB8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem253Q3UNB8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem253Q3UNB8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Tmem253Q3UNB8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem253Q3UNB8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem253Q3UNB8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem253Q3UNB8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Tmem253Q3UNB8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem253Q3UNB8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem253Q3UNB8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem253Q3UNB8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem253Q3UNB8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem253Q3UNB8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Tmem253Q3UNB8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem253Q3UNB8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem253Q3UNB8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem253Q3UNB8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem253Q3UNB8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tmem253Q3UNB8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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Tmem253Q3UNB8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Tmem253Q3UNB8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem253Q3UNB8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem253Q3UNB8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Tmem253Q3UNB8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem253Q3UNB8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem253Q3UNB8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem253Q3UNB8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmem253Q3UNB8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Tmem253Q3UNB8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Tmem253Q3UNB8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Tmem253Q3UNB8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Tmem253Q3UNB8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmem253Q3UNB8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms