Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW8

Parp3, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp3Q3ULW8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Parp3Q3ULW8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Parp3Q3ULW8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Parp3Q3ULW8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Parp3Q3ULW8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Parp3Q3ULW8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Parp3Q3ULW8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Parp3Q3ULW8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Parp3Q3ULW8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Parp3Q3ULW8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Parp3Q3ULW8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Parp3Q3ULW8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Parp3Q3ULW8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Parp3Q3ULW8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Parp3Q3ULW8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Parp3Q3ULW8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Parp3Q3ULW8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Parp3Q3ULW8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Parp3Q3ULW8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Parp3Q3ULW8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Parp3Q3ULW8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Parp3Q3ULW8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Parp3Q3ULW8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Parp3Q3ULW8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Parp3Q3ULW8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Parp3Q3ULW8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Parp3Q3ULW8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Parp3Q3ULW8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Parp3Q3ULW8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Parp3Q3ULW8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Parp3Q3ULW8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Parp3Q3ULW8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Parp3Q3ULW8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Parp3Q3ULW8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Parp3Q3ULW8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Parp3Q3ULW8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Parp3Q3ULW8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Parp3Q3ULW8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Parp3Q3ULW8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Parp3Q3ULW8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Parp3Q3ULW8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Parp3Q3ULW8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Parp3Q3ULW8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Parp3Q3ULW8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Parp3Q3ULW8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Parp3Q3ULW8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Parp3Q3ULW8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms