Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc33Q3ULW6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc33Q3ULW6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc33Q3ULW6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc33Q3ULW6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc33Q3ULW6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc33Q3ULW6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc33Q3ULW6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc33Q3ULW6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc33Q3ULW6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc33Q3ULW6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc33Q3ULW6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc33Q3ULW6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc33Q3ULW6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc33Q3ULW6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc33Q3ULW6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc33Q3ULW6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc33Q3ULW6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc33Q3ULW6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc33Q3ULW6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc33Q3ULW6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc33Q3ULW6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc33Q3ULW6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc33Q3ULW6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc33Q3ULW6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc33Q3ULW6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc33Q3ULW6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc33Q3ULW6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc33Q3ULW6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc33Q3ULW6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc33Q3ULW6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc33Q3ULW6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 226.2 ms