Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL33

E330014E10Rik, Predicted gene 3286, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330014E10RikQ3UL33 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E330014E10RikQ3UL33 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E330014E10RikQ3UL33 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E330014E10RikQ3UL33 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E330014E10RikQ3UL33 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E330014E10RikQ3UL33 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E330014E10RikQ3UL33 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E330014E10RikQ3UL33 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E330014E10RikQ3UL33 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
E330014E10RikQ3UL33 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
E330014E10RikQ3UL33 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E330014E10RikQ3UL33 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
E330014E10RikQ3UL33 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E330014E10RikQ3UL33 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E330014E10RikQ3UL33 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E330014E10RikQ3UL33 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
E330014E10RikQ3UL33 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E330014E10RikQ3UL33 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E330014E10RikQ3UL33 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
E330014E10RikQ3UL33 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E330014E10RikQ3UL33 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E330014E10RikQ3UL33 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
E330014E10RikQ3UL33 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E330014E10RikQ3UL33 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
E330014E10RikQ3UL33 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E330014E10RikQ3UL33 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E330014E10RikQ3UL33 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E330014E10RikQ3UL33 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
E330014E10RikQ3UL33 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E330014E10RikQ3UL33 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms