Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc34Q3UI66 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc34Q3UI66 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc34Q3UI66 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc34Q3UI66 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc34Q3UI66 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc34Q3UI66 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc34Q3UI66 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc34Q3UI66 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc34Q3UI66 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc34Q3UI66 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc34Q3UI66 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc34Q3UI66 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc34Q3UI66 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc34Q3UI66 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc34Q3UI66 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc34Q3UI66 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc34Q3UI66 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc34Q3UI66 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc34Q3UI66 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc34Q3UI66 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc34Q3UI66 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc34Q3UI66 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc34Q3UI66 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc34Q3UI66 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc34Q3UI66 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc34Q3UI66 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc34Q3UI66 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc34Q3UI66 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc34Q3UI66 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc34Q3UI66 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.5 ms