Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx27Q3UHD6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx27Q3UHD6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx27Q3UHD6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx27Q3UHD6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snx27Q3UHD6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx27Q3UHD6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx27Q3UHD6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx27Q3UHD6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx27Q3UHD6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx27Q3UHD6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx27Q3UHD6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx27Q3UHD6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snx27Q3UHD6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx27Q3UHD6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx27Q3UHD6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx27Q3UHD6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx27Q3UHD6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx27Q3UHD6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx27Q3UHD6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx27Q3UHD6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx27Q3UHD6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx27Q3UHD6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx27Q3UHD6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx27Q3UHD6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx27Q3UHD6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx27Q3UHD6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx27Q3UHD6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx27Q3UHD6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx27Q3UHD6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Snx27Q3UHD6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx27Q3UHD6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx27Q3UHD6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx27Q3UHD6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx27Q3UHD6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms