Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGS4

Mcrip1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcrip1Q3UGS4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mcrip1Q3UGS4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mcrip1Q3UGS4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms