Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEI1

Pde4c, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, mousemouse

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Length 686 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde4cQ3UEI1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pde4cQ3UEI1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pde4cQ3UEI1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pde4cQ3UEI1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Pde4cQ3UEI1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pde4cQ3UEI1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pde4cQ3UEI1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pde4cQ3UEI1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pde4cQ3UEI1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pde4cQ3UEI1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pde4cQ3UEI1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pde4cQ3UEI1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pde4cQ3UEI1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pde4cQ3UEI1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pde4cQ3UEI1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Pde4cQ3UEI1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pde4cQ3UEI1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pde4cQ3UEI1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pde4cQ3UEI1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pde4cQ3UEI1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pde4cQ3UEI1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pde4cQ3UEI1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pde4cQ3UEI1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pde4cQ3UEI1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pde4cQ3UEI1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pde4cQ3UEI1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pde4cQ3UEI1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pde4cQ3UEI1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pde4cQ3UEI1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pde4cQ3UEI1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Pde4cQ3UEI1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pde4cQ3UEI1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Pde4cQ3UEI1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Pde4cQ3UEI1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pde4cQ3UEI1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pde4cQ3UEI1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pde4cQ3UEI1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pde4cQ3UEI1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pde4cQ3UEI1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Pde4cQ3UEI1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Pde4cQ3UEI1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pde4cQ3UEI1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pde4cQ3UEI1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pde4cQ3UEI1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Pde4cQ3UEI1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pde4cQ3UEI1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pde4cQ3UEI1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pde4cQ3UEI1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pde4cQ3UEI1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pde4cQ3UEI1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Pde4cQ3UEI1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Pde4cQ3UEI1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Pde4cQ3UEI1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pde4cQ3UEI1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pde4cQ3UEI1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pde4cQ3UEI1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
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Pde4cQ3UEI1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pde4cQ3UEI1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pde4cQ3UEI1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pde4cQ3UEI1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pde4cQ3UEI1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pde4cQ3UEI1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pde4cQ3UEI1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pde4cQ3UEI1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pde4cQ3UEI1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pde4cQ3UEI1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pde4cQ3UEI1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pde4cQ3UEI1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pde4cQ3UEI1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pde4cQ3UEI1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pde4cQ3UEI1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pde4cQ3UEI1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Pde4cQ3UEI1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Pde4cQ3UEI1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pde4cQ3UEI1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pde4cQ3UEI1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pde4cQ3UEI1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pde4cQ3UEI1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pde4cQ3UEI1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pde4cQ3UEI1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pde4cQ3UEI1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pde4cQ3UEI1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Pde4cQ3UEI1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pde4cQ3UEI1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pde4cQ3UEI1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pde4cQ3UEI1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Pde4cQ3UEI1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pde4cQ3UEI1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pde4cQ3UEI1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pde4cQ3UEI1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pde4cQ3UEI1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pde4cQ3UEI1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Pde4cQ3UEI1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pde4cQ3UEI1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pde4cQ3UEI1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pde4cQ3UEI1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Pde4cQ3UEI1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Pde4cQ3UEI1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pde4cQ3UEI1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms