Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Parp8Q3UD82 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Parp8Q3UD82 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Parp8Q3UD82 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Parp8Q3UD82 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Parp8Q3UD82 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Parp8Q3UD82 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Parp8Q3UD82 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Parp8Q3UD82 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Parp8Q3UD82 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Parp8Q3UD82 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Parp8Q3UD82 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Parp8Q3UD82 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Parp8Q3UD82 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Parp8Q3UD82 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Parp8Q3UD82 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Parp8Q3UD82 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Parp8Q3UD82 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Parp8Q3UD82 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Parp8Q3UD82 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Parp8Q3UD82 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Parp8Q3UD82 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Parp8Q3UD82 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Parp8Q3UD82 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Parp8Q3UD82 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Parp8Q3UD82 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Parp8Q3UD82 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Parp8Q3UD82 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Parp8Q3UD82 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Parp8Q3UD82 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Parp8Q3UD82 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Parp8Q3UD82 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Parp8Q3UD82 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Parp8Q3UD82 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Parp8Q3UD82 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms