Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Otud5Q3U2S4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Otud5Q3U2S4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Otud5Q3U2S4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Otud5Q3U2S4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Otud5Q3U2S4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Otud5Q3U2S4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Otud5Q3U2S4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Otud5Q3U2S4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Otud5Q3U2S4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Otud5Q3U2S4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Otud5Q3U2S4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Otud5Q3U2S4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Otud5Q3U2S4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Otud5Q3U2S4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Otud5Q3U2S4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Otud5Q3U2S4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Otud5Q3U2S4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Otud5Q3U2S4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Otud5Q3U2S4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Otud5Q3U2S4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Otud5Q3U2S4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Otud5Q3U2S4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Otud5Q3U2S4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Otud5Q3U2S4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Otud5Q3U2S4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Otud5Q3U2S4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Otud5Q3U2S4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Otud5Q3U2S4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Otud5Q3U2S4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Otud5Q3U2S4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Otud5Q3U2S4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Otud5Q3U2S4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Otud5Q3U2S4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Otud5Q3U2S4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Otud5Q3U2S4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Otud5Q3U2S4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Otud5Q3U2S4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Otud5Q3U2S4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Otud5Q3U2S4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Otud5Q3U2S4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Otud5Q3U2S4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Otud5Q3U2S4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Otud5Q3U2S4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Otud5Q3U2S4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Otud5Q3U2S4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Otud5Q3U2S4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Otud5Q3U2S4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Otud5Q3U2S4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Otud5Q3U2S4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Otud5Q3U2S4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Otud5Q3U2S4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Otud5Q3U2S4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Otud5Q3U2S4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Otud5Q3U2S4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Otud5Q3U2S4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Otud5Q3U2S4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Otud5Q3U2S4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Otud5Q3U2S4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Otud5Q3U2S4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Otud5Q3U2S4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Otud5Q3U2S4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Otud5Q3U2S4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Otud5Q3U2S4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Otud5Q3U2S4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Otud5Q3U2S4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Otud5Q3U2S4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Otud5Q3U2S4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Otud5Q3U2S4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Otud5Q3U2S4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Otud5Q3U2S4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms